有臨醫藥:美國FDA就資料遞交新格式(Dataset-JSON)徵求公眾意見或預示臨床試驗資料遞交新紀元

有臨醫藥:美國FDA就資料遞交新格式(Dataset-JSON)徵求公眾意見或預示臨床試驗資料遞交新紀元

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美國FDA就資料遞交新格式

(Dataset-JSON)徵求公眾意見

或預示臨床試驗資料遞交新紀元



最新進展:美國FDA

就Dataset-JSON格式徵求意見


2025年4月9日FDA就未來是否接受將Dataset-JSON作為監管申請中電子研究資料交換標準一事徵求公眾意見,意見反饋截止日期為2025年6月9日[1]。徵求意見稿提及FDA正在探索採用臨床資料交換標準協會(CDISC)的Dataset-JSON v1.1作為新的交換標準,未來替代SAS XPORT v5用於向生物製品評價與研究中心(CBER)和藥品評價與研究中心(CDER)提交電子研究資料。該徵求意見稿建議公眾從以下兩方面反饋意見:


  • 行業採用Dataset-JSON作為向FDA提交電子研究資料新標準的風險與收益。

  • 現有工具和系統在整合過程中可能面臨的挑戰。


在此之前,2023年7月至2024年6月,製藥行業使用者軟體交流協會(PHUSE:Pharmaceutical Users Software Exchange)、臨床資料交換標準協會(CDISC)與美國食品藥品監督管理局(FDA)三方攜手,開展了一項具有里程碑意義的“Dataset-JSON作為監管遞交替代傳輸格式”試點專案。這項歷時近一年的研究所釋出的最終報告揭示了一個重要行業趨勢:JSON格式正逐步獲得FDA的官方認可,有望成為未來臨床試驗資料遞交的新標準[2]


根據FDA最新版《以電子格式提供監管提交—標準化研究資料行業指南》(2021年6月Revision 2)[3],目前FDA仍主要接受SAS XPT(V5傳輸格式)作為標準遞交格式。但值得關注的是,FDA的“資料現代化行動計劃”(Data Modernization Action Plan)已明確將鼓勵使用更現代的資料格式作為戰略重點。此次試點正是這一戰略的重要實踐環節,標誌着FDA向資料標準現代化邁出了實質性一步[4]

試點專案吸引了來自全球頂尖製藥公司、CRO和技術供應商的廣泛參與,包括強生、默克、羅氏等19家機構提交了詳細的測試反饋。FDA/CDER(藥物評價與研究中心)也親自參與了五個臨床研究和三個非臨床研究的測試遞交,對Dataset-JSON的實際表現進行了全面評估。








01.





JSON格式與CDISC

Dataset-JSON v1.1深度解析

JSON技術優勢

JSON(JavaScript Object Notation)作為一種輕量級的資料交換格式,在現代資訊科技領域已獲得廣泛應用,其核心優勢包括:

人類可讀性:採用純文字格式,數據結構清晰直觀

跨平臺性:幾乎所有現代程式語言都提供原生支援

靈活性:支援複雜的層次化、巢狀數據結構

擴充套件性:可輕鬆新增新欄位而不影響現有解析邏輯

網路友好:是RESTful API的事實標準格式


CDISC Dataset-JSON v1.1創新特性

CDISC Dataset-JSON是專為滿足監管遞交需求而設計的現代化資料集格式,v1.1版本在以下方面實現了重要突破:

效能最佳化:

- 檔案體積比傳統XPT格式平均減小30-50%

- 新增NDJSON(Newline Delimited JSON)支援,可實現大資料集的流式處理

資料型別增強:

- 引入decimal資料型別,解決浮點數精度問題

- 採用ISO 8601標準表示日期時間,避免SAS與R等系統間的日期紀元差異

- 新增Boolean等ODM資料型別支援

結構簡化

- 扁平化數據結構,將"itemData"改為更直觀的"rows"

- 用"columns"替代原有的"items"命名,提高可讀性

後設資料整合:

- 內建豐富後設資料,減少對外部define.xml的依賴

- 新增targetDataType屬性,明確資料型別轉換規則

國際化支援:

- 預設採用UTF-8編碼,完整支援非ASCII字元

- 解決了傳統XPT格式在非英語字元處理上的侷限性






02.





Dataset-JSON與XPT格式

全方位對比

技術規格對比


對比維度 Dataset-JSON XPT (SAS V5傳輸格式)
格式標準 開放標準(MIT許可證) SAS專有格式
數據結構 支援複雜層次結構 僅限平面表格結構
後設資料支援 內線豐富後設資料 需單獨define.xml檔案
字元編碼 UTF-8(完整Unicode支援) 僅支援ASCII字符集
開發工具 幾乎所有程式語言原生支援 主要依賴SAS生態系統
檔案壓縮率 平均減少30%-50% 體積較大
API支援 原生適合API傳輸 不適合現代API架構
資料精度 支援decimal精確小數 存在浮點數精度問題
日期處理 ISO 8601 標準日期時間 依賴SAS日期紀元(1960年基準)

有臨醫藥:美國FDA就資料遞交新格式(Dataset-JSON)徵求公眾意見或預示臨床試驗資料遞交新紀元有臨醫藥:美國FDA就資料遞交新格式(Dataset-JSON)徵求公眾意見或預示臨床試驗資料遞交新紀元

試點中發現的關鍵差異

數據處理能力:

- Dataset-JSON成功處理了包含非ASCII字元的測試案例,而XPT轉換此類字元會存在一定問題

- 在包含長變數名(超過8個字元)的資料集中,Dataset-JSON表現完美,XPT則出現截斷

工具相容性:

- Dataset-JSON能被所有測試的資料管理工具正確解析

- 但當前主流分析工具(SAS、JMP等)尚未完全適配,需要程式碼調整

後設資料完整性:

- Dataset-JSON轉換回XPT時會丟失部分後設資料

- 試點建議保留兩種格式副本以確保資料追溯性

行業接受度:

- 89%的測試機構使用SAS進行格式轉換

- 但95%的機構成功完成了雙向轉換,證明技術可行性






03.





Dataset-JSON未來展望

短期(1-2年):

- XPT仍是主要遞交格式

- Dataset-JSON在複雜數據結構、ePRO資料等場景試點應用

- 工具廠商(如SAS/JMP)更新軟體支援,適配Dataset-JSON的後設資料載入

- PHUSE/CDISC將繼續制定商業案例和長期發展路線圖


中期(2-3年):

- FDA可能釋出Dataset-JSON採納時間表

- 預計2025-2026年進入FDA資料標準目錄

- 成為某些遞交場景的推薦格式


長期(3-5年):

- 可能成為與XPT並列的標準格式

- 在API資料交換領域佔據主導地位

- 全面釋放CDISC標準的潛力






04.





必備資源指南

核心規範文件:

CDISC Dataset-JSON v1.1標準規範

https://www.cdisc.org/standards/data-exchange/dataset-json/dataset-json-v1-1

CDISC Dataset-JSON Specification

https://cdisc-org.github.io/DataExchange-DatasetJson/doc/dataset-json1-1.html

監管政策檔案:

FDA《電子遞交指南》2021版

https://www.fda.gov/media/82716/download

FDA Study Data Technical Conformance Guide - March 2025

https://www.fda.gov/media/153632/download


試點研究成果:

PHUSE Dataset-JSON最終報告

https://phuse.s3.eu-central-1.amazonaws.com/Deliverables/Optimizing+the+Use+of+Data+Standards/WP-88+Dataset-JSON+Report.pdf


COSA Hackathon解決方案集

https://union1.sharepoint.cn/sites/BDM/Shared%20Documents/A02_市場與品牌建設/公眾號文章/2025/2025-04%20臨床試驗資料遞交新紀元/COSA%20Hackathon解決方案集

實用工具資源:

COSA Repository Directory

https://cosa.cdisc.org




隨著生命科學行業數字化轉型加速,Dataset-JSON代表的資料現代化趨勢已不可逆轉。建議行業同仁把握這一變革機遇,從今天開始佈局準備,共同迎接臨床試驗資料遞交的新紀元。


Tips:定期檢視FDA資料標準目錄,及時獲取Dataset-JSON採納進展的最新資訊!


Tips:可報名參加CDISC中國近期相關直播活動,詳見CDISC中國公眾號。









參考文獻:

[1] FDA Requests Public Comment on CDISC Dataset-JSON Standard

https://www.cdisc.org/public-review/fda-requests-public-comment-cdisc-dataset-json-standard

[2] Dataset-JSON as an Alternative Transport Format for Regulatory Submissions: Final Pilot Report

https://phuse.s3.eu-central-1.amazonaws.com/Deliverables/Optimizing+the+Use+of+Data+Standards/WP-88+Dataset-JSON+Report.pdf

[3] Providing Regulatory Submissions in Electronic Format — Standardized Study Data Guidance for Industry

https://www.fda.gov/media/82716/download

[4] FDA Data Modernization Action Plan

https://www.fda.gov/about-fda/reports/data-modernization-action-plan




撰寫:李斯友、何志豪

稽覈:章飛燕、張子豹


完結


原文連結: https://mp.weixin.qq.com/s/ZxonHYBq3spjwgPfhoCzng

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